Le Danemark semble ne pas être le premier foyer.......
Aux Pays-Bas, le séquençage du génome entier des éclosions de SARSCOV2 dans 16 élevages de visons a révélé une transmission du virus entre l'homme et le vison et le vison vers l'homme. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer si les visons risquent de devenir un réservoir de SRAS-CoV-2.
Le SRAS-CoV-2 a été diagnostiqué pour la première fois dans deux fermes de visons aux Pays-Bas le 23 avril (NB1) et le 25 avril (NB2), respectivement. Après la détection initiale du SRAS-CoV-2 dans ces fermes, une enquête approfondie a été lancée pour identifier les voies de transmission potentielles et effectuer une évaluation des risques environnementaux et professionnels. Ici, nous décrivons les résultats de l'enquête sur l'épidémie des 16 premiers élevages de visons infectés par le SRAS-CoV-2 en combinant le diagnostic du SRAS-CoV-2, le WGS et des entretiens approfondis.
Les propriétaires et les employés des 16 élevages de visons positifs au SRAS-CoV-2 ont été inclus dans l'enquête de recherche des contacts des services de santé municipaux et testés conformément au protocole national. Au total, 97 personnes ont été testées par des tests sérologiques et / ou RT-PCR. Au total, 43 des 88 (49%) échantillons des voies respiratoires supérieures ont été testés positifs par RT-PCR tandis que 38 des 75 (51%) échantillons de sérum ont été testés positifs pour les anticorps spécifiques du SARS-CoV-2. Au total, 66 des 97 (68%) des personnes testées présentaient des preuves d'infection par le SRAS-CoV-2
Les séquences générées par les élevages de visons et par les employés des élevages de visons ont été comparées à la base de données nationale comprenant environ 1 775 WGS. Pour faire la distinction entre les infections acquises dans la communauté et l'infection par le SRAS-CoV-2 liée aux élevages de visons, et pour déterminer le risque potentiel pour les personnes vivant à proximité des élevages de visons, le WGS a également été réalisé sur 34 échantillons positifs au SRAS-CoV-2, échantillonnés du 04-03 De -2020 au 29-04-2020, par des particuliers qui vivent dans la même zone de code postal à quatre chiffres que les quatre premières fermes de visons. Ces séquences locales, échantillonnées dans un proxy d'environ 19 km 2, reflétaient la diversité générale du SRAS-CoV-2 observé aux Pays-Bas et n'étaient pas liés aux grappes de séquences de visons trouvées dans les fermes de visons, indiquant ainsi qu'il n'y avait pas eu de retombées pour les personnes vivant à proximité des fermes de visons et que les séquences d'animaux infectés par le SRAS-CoV-2 et d'ouvriers agricoles regroupés par ferme (séquences de la communauté montrées en magenta, Fig. 2 ). Les séquences de l'enquête sur les élevages de visons ont également été comparées à des séquences de Pologne (n = 65), car de nombreux ouvriers agricoles de visons étaient des migrants saisonniers de Pologne, mais ces séquences étaient plus divergentes.
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